科学、安全、合理、高效地使用兽药，不仅能及时有效预防和治疗动物疾病，降低饲养成本，而且对有效控制疾病和减少药物残留，提高产品质量安全水平具有重要意义。科学使用兽药，要把握好以下几个的原则：
    坚持防重于治的原则。对于畜禽养殖，要从控制环境出发，切实做好产地环境建设，污染物无害化处理，消毒措施落实，种畜禽引进，免疫程序制定等工作，有计划、有目的地适时预防，对病畜禽及时采取隔离和扑杀等措施，防止疫情扩散和传播。
    坚持对症下药的原则。不同的疾病使用不同的药物，同一种疾病也不能长期使用某一种药物治疗。当发生某种疾病时，要根据饲养条件（环境、饲料、管理）、生产性能、流行病学、临床症状、解剖变化、实验室检验结果等综合分析，做出准确的诊断，然后有针对性地选择药物，达到“药半功倍”的效果，彻底杜绝滥用兽药和无病用药现象。
    坚持适度剂量的原则。防治畜禽疫病，如果剂量用小了，达不到预防或治疗效果，而且容易导致耐药性菌株的产生，甚至耽误时机造成疫病的发生或病情恶化；剂量用大了，既造成浪费，增加成本，又会产生药物残留或中毒等不良反应。所以掌握适度的剂量，对确保防治效果和降低饲养成本具有十分重要的作用。
    坚持合理疗程的原则。对常规畜禽疾病来说，一个疗程一般约为3天-5天，如果用药时间过短，达不到理想的治疗效果，甚至会复发，并可能给后续治疗带来困难；如果用药时间过长，不仅造成药物浪费，而且药物残留严重污染环境。因此，在治疗畜禽疾病时，必须准确把握疗程，长短合理。
    坚持正确给药的原则。根据动物的生理机能、代谢特点各不相同，给药的模式也各不相同，一是能够通过调节饲料营养成分而达到治疗目的的不用药，能够通过饮用或饲喂给药治疗的不注射，能够通过注射治疗的不输液；二是根据药物的特征特性和疫病的特征通过外用，内服，皮下注射，肌肉注射，静脉注射等方法给药。在给药过程中，按照规定要求，根据药物及其停药期的不同，在畜禽出栏或屠宰前及时停药，可以避免残留药物污染食品。